自公布之日起，新版基药目录在行业内已经泛起了不小的波澜。业界高度看好2012年版目录对整个医药行业的影响，其关注度远高于2009年版，但也可以看出，因其实施程度和实施范围显著扩大，相近品种竞争加剧，企业综合实力如客户资源分布、经销商网络和代理商质量等将导致竞争优劣势明显分化。
 
　　独家品种成争夺焦点
 
　　新版基药目录把一些中成药企业的独家品种列入目录之中，这样就等于把一些市场全部给了部分企业，但细看不难发现，这些企业都是在民族药或者中成药有独特贡献的，比如神威药业、以岭药业、康缘药业等，中成药相较西药来说，价格低、副作用小等，此次目录新增了这些品种和品规，是一种进步的表现。
 
　　随着基药目录的公布，各省的招标方案和增补方案将会备受关注。尽管许多厂家的业务人员表现得很淡定，但经营企业和部分代理商早已闻风而动，开始了资源的争夺战。不难发现，这次增加的213个品种特别是中成药和独家品种成为了争夺的焦点。如康缘药业的3个主导产品：桂芝茯苓胶囊、腰痹通胶囊和南星止通膏，天士力的养血清脑颗粒、以岭药业的莲花清瘟胶囊和参松养心胶囊等。
 
　　兼并重组更常态化
 
　　此次新版基药目录的出台有多重重要意义，不仅关系着老百姓的用药，更关系到很多药品生产企业和经营企业甚至从业个人的生死存亡。从新版基药目录呈现的特点来看，将会导致医药行业产生一种奇怪的“买猪和卖猪”现象，即企业的并购与被并购。
 
　　新版基药目录最主要的是增加了品种，增加了类别，增加了儿童药。目前临床上儿童药，特别是能进入医保和新农合的儿童用药特别急需，此次基药目录缓解了这一问题，让医生有了更多的选择，让患者的看病成本大幅度下降。同时，大病、特病用药有了新的保障，如抗肿瘤、血液病、精神类、艾滋病等病种的用药范围有所扩大。